MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 6330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	T	6	6	32	37	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018609	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018609	AG	3	6	119	124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018609	T	6	6	128	133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018609	AAAT	2	8	184	191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018609	A	6	6	212	217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018609	TGG	2	6	270	275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018609	GAA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018609	A	6	6	297	302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018609	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018609	T	6	6	372	377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018609	AT	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018609	AATTC	2	10	471	480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018609	TACGC	2	10	566	575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018609	A	6	6	622	627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018609	CTC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018609	AGT	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018609	CGG	2	6	751	756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018609	CGA	2	6	835	840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018609	GCC	2	6	859	864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018609	GGGC	2	8	925	932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018609	ATTT	2	8	1837	1844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018609	A	6	6	2856	2861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018609	T	7	7	4243	4249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018609	TTA	2	6	5404	5409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018609	AAATT	2	10	5428	5437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018609	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018609	TTG	2	6	6491	6496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018609	AGT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018609	T	6	6	7224	7229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018609	TTTA	2	8	7241	7248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018609	T	7	7	7254	7260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018609	ATTA	2	8	8512	8519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018609	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018609	T	6	6	8780	8785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018609	TTC	2	6	8851	8856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018609	T	7	7	8875	8881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018609	T	6	6	8942	8947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018609	GTC	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018609	TTA	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018609	GTG	2	6	9140	9145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018609	ACT	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018609	AATTTT	2	12	11925	11936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018609	ATT	2	6	12017	12022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018609	TGT	2	6	12190	12195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018609	TTTG	2	8	12205	12212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018609	CTG	2	6	13029	13034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018609	ACA	2	6	14508	14513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018609	CTT	2	6	14538	14543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018609	A	7	7	14596	14602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018609	GTC	2	6	15317	15322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018609	AAGA	2	8	15369	15376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018609	CTA	2	6	15386	15391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018609	T	6	6	15456	15461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018609	TGT	2	6	15524	15529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018609	AATA	2	8	15561	15568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018609	AAG	2	6	15583	15588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018609	AAT	2	6	15604	15609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018609	A	6	6	15670	15675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018609	AAC	2	6	15743	15748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018609	A	7	7	15758	15764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018609	ACT	2	6	15835	15840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018609	AAT	2	6	15853	15858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018609	ATA	2	6	15881	15886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018609	T	6	6	18979	18984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018609	AGGG	2	8	19049	19056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018609	AAT	2	6	19069	19074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018609	A	7	7	19126	19132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018609	T	7	7	19758	19764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018609	TGG	2	6	19801	19806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018609	GAA	2	6	19815	19820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018609	TAA	2	6	19863	19868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018609	T	6	6	19903	19908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018609	TTC	2	6	20038	20043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018609	TAA	2	6	20358	20363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018609	T	6	6	20398	20403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018609	TTC	2	6	20533	20538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018609	A	6	6	20667	20672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018609	AGT	2	6	20774	20779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018609	TGG	2	6	20791	20796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018609	GAA	2	6	20805	20810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018609	TAA	2	6	20853	20858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018609	T	6	6	20893	20898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018609	TTC	2	6	21028	21033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018609	CAAA	2	8	21330	21337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018609	ATT	2	6	22161	22166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018609	T	6	6	22325	22330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018609	TAC	2	6	22521	22526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018609	GTT	2	6	22556	22561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018609	A	6	6	22617	22622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018609	AGT	2	6	22724	22729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018609	GCTTT	2	10	22750	22759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018609	CGGG	2	8	22760	22767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018609	AGT	2	6	22867	22872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018609	TTGTC	2	10	22884	22893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018609	GTC	2	6	23714	23719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018609	TTTG	2	8	23849	23856	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018609	TTA	2	6	25090	25095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018609	A	7	7	25147	25153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018609	TTG	2	6	25180	25185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018609	T	7	7	26030	26036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018609	ACT	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018609	T	6	6	26173	26178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018609	GTT	2	6	26199	26204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018609	GCAG	2	8	27192	27199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018609	CTAC	2	8	27217	27224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018609	TGAAC	2	10	27227	27236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018609	TCT	2	6	27321	27326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018609	CAATTT	2	12	27371	27382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_018609	AAG	2	6	27417	27422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018609	GGT	2	6	28240	28245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018609	GAT	2	6	28252	28257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018609	T	7	7	28257	28263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018609	GTC	2	6	28272	28277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018609	GAA	2	6	28345	28350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018609	TGT	2	6	28414	28419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018609	ACG	2	6	28420	28425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018609	TTTG	2	8	29293	29300	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018609	TTTG	2	8	29438	29445	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018609	TTGAA	2	10	30754	30763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018609	TTA	2	6	31797	31802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018609	AAT	2	6	31817	31822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018609	ATAA	2	8	31845	31852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018609	TTAT	2	8	31855	31862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018609	T	7	7	31876	31882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018609	A	6	6	31885	31890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018609	AT	3	6	31917	31922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018609	ATA	2	6	31930	31935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018609	ACT	2	6	31944	31949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018609	ATT	2	6	31988	31993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018609	T	7	7	33509	33515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018609	ATT	2	6	33541	33546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018609	T	7	7	33545	33551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018609	A	7	7	33563	33569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018609	TAAT	2	8	33570	33577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018609	TTTA	2	8	33608	33615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018609	TTAT	2	8	34457	34464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018609	AATC	2	8	34465	34472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018609	AAAT	2	8	34541	34548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018609	TAA	2	6	34553	34558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018609	TAA	2	6	36841	36846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018609	A	7	7	36845	36851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018609	T	6	6	36871	36876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018609	TAT	2	6	36889	36894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018609	A	6	6	38379	38384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018609	AAAC	2	8	38389	38396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018609	AAT	2	6	38415	38420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018609	TCG	2	6	38486	38491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018609	TCC	2	6	38493	38498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_018609	A	6	6	38501	38506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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